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5MBしかないlinuxのalpineに python3.4とnumpy,scipy,matplotlib,jupyter,...入れることができた。

https://github.com/catholabs/docker-alpineを参考にBLASとLAPACKをいれる。 下記を実行。

apk add --update musl python3 python3-dev alpine-sdk gfortran freetype freetype-dev
sh ./blas.sh
sh ./lapack.sh
BLAS=~/src/BLAS/libfblas.a
LAPACK=~/src/lapack-3.5.0/liblapack.a
export BLAS
export LAPACK
pip3 install -U pip
pip3 install numpy==1.9.3 scipy matplotlib jupyter ...